Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NclP09405 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NclP09405 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NclP09405 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NclP09405 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NclP09405 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NclP09405 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NclP09405 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NclP09405 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NclP09405 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NclP09405 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NclP09405 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NclP09405 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NclP09405 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NclP09405 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NclP09405 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NclP09405 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NclP09405 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NclP09405 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NclP09405 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NclP09405 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NclP09405 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NclP09405 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NclP09405 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NclP09405 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NclP09405 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NclP09405 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NclP09405 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NclP09405 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NclP09405 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NclP09405 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NclP09405 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NclP09405 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NclP09405 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NclP09405 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NclP09405 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NclP09405 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NclP09405 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NclP09405 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NclP09405 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NclP09405 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NclP09405 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NclP09405 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NclP09405 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NclP09405 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NclP09405 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NclP09405 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NclP09405 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NclP09405 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NclP09405 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NclP09405 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NclP09405 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NclP09405 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NclP09405 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NclP09405 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NclP09405 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NclP09405 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NclP09405 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NclP09405 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NclP09405 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NclP09405 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NclP09405 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NclP09405 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NclP09405 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NclP09405 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NclP09405 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NclP09405 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NclP09405 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NclP09405 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NclP09405 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NclP09405 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NclP09405 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NclP09405 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NclP09405 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NclP09405 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NclP09405 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NclP09405 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NclP09405 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NclP09405 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NclP09405 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NclP09405 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NclP09405 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NclP09405 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NclP09405 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NclP09405 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NclP09405 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NclP09405 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NclP09405 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NclP09405 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NclP09405 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NclP09405 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NclP09405 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NclP09405 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NclP09405 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NclP09405 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NclP09405 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NclP09405 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NclP09405 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NclP09405 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NclP09405 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.8 ms