Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gadd45gip1Q9CR59 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms