Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nkx6-3Q3UHX8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nkx6-3Q3UHX8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nkx6-3Q3UHX8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nkx6-3Q3UHX8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nkx6-3Q3UHX8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nkx6-3Q3UHX8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nkx6-3Q3UHX8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nkx6-3Q3UHX8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nkx6-3Q3UHX8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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