Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx6Q9ER75 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms