Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rassf9Q8K342 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms