Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NipblQ6KCD5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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NipblQ6KCD5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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