Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms