Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pfdn6Q03958 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms