Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna3O08545 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna3O08545 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna3O08545 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna3O08545 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna3O08545 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna3O08545 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms