Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH24

Tm9sf4, Transmembrane 9 superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf4Q8BH24 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf4Q8BH24 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf4Q8BH24 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf4Q8BH24 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf4Q8BH24 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf4Q8BH24 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf4Q8BH24 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf4Q8BH24 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf4Q8BH24 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf4Q8BH24 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf4Q8BH24 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf4Q8BH24 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf4Q8BH24 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf4Q8BH24 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf4Q8BH24 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf4Q8BH24 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf4Q8BH24 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tm9sf4Q8BH24 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tm9sf4Q8BH24 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tm9sf4Q8BH24 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tm9sf4Q8BH24 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tm9sf4Q8BH24 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf4Q8BH24 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.3 ms