Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MitfQ08874 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MitfQ08874 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MitfQ08874 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MitfQ08874 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MitfQ08874 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MitfQ08874 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MitfQ08874 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MitfQ08874 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MitfQ08874 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MitfQ08874 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 219.1 ms