Protein–RNA interactions for Protein: O35242

Nsmaf, Protein FAN, mousemouse

Predictions only

Length 920 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmafO35242 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmafO35242 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmafO35242 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmafO35242 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmafO35242 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NsmafO35242 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms