Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms