Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4933402E13RikQ9D4D2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4933402E13RikQ9D4D2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4933402E13RikQ9D4D2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4933402E13RikQ9D4D2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
4933402E13RikQ9D4D2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
4933402E13RikQ9D4D2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4933402E13RikQ9D4D2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4933402E13RikQ9D4D2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
4933402E13RikQ9D4D2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4933402E13RikQ9D4D2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4933402E13RikQ9D4D2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
4933402E13RikQ9D4D2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4933402E13RikQ9D4D2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4933402E13RikQ9D4D2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
4933402E13RikQ9D4D2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4933402E13RikQ9D4D2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4933402E13RikQ9D4D2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4933402E13RikQ9D4D2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms