Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms