Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efna3O08545 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Efna3O08545 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Efna3O08545 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efna3O08545 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efna3O08545 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efna3O08545 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efna3O08545 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efna3O08545 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms