Protein–RNA interactions for Protein: G3UVW3

Slc38a6, Probable sodium-coupled neutral amino acid transporter 6, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a6G3UVW3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc38a6G3UVW3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a6G3UVW3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms