Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx6Q9ER75 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms