Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdc1Q5PSV9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms