Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS2

Zscan4f, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4fQ3URS2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zscan4fQ3URS2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zscan4fQ3URS2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms