Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnga1P29974 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms