Protein–RNA interactions for Protein: P23506

Pcmt1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmt1P23506 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcmt1P23506 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcmt1P23506 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcmt1P23506 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcmt1P23506 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcmt1P23506 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcmt1P23506 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcmt1P23506 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcmt1P23506 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcmt1P23506 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcmt1P23506 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcmt1P23506 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcmt1P23506 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcmt1P23506 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcmt1P23506 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcmt1P23506 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcmt1P23506 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcmt1P23506 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcmt1P23506 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcmt1P23506 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcmt1P23506 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcmt1P23506 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcmt1P23506 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcmt1P23506 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms