Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox13F6YCR7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms