Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms