Protein–RNA interactions for Protein: Q8K215

Lyrm4, LYR motif-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyrm4Q8K215 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Lyrm4Q8K215 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lyrm4Q8K215 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms