Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM11

Tgm6, Transglutaminase 6, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm6Q8BM11 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgm6Q8BM11 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tgm6Q8BM11 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tgm6Q8BM11 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tgm6Q8BM11 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tgm6Q8BM11 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tgm6Q8BM11 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tgm6Q8BM11 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tgm6Q8BM11 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm6Q8BM11 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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