Protein–RNA interactions for Protein: Q12513

TMA17, Translation machinery-associated protein 17, yeast

Predictions only

Length 150 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TMA17	Q12513	CDC65	tQ(CUG)M	72 nt		-1.41	□□□□□ -2.64
TMA17	Q12513	YLL066W-B	YLL066W-B	171 nt		-1.41	□□□□□ -2.64
TMA17	Q12513	snR77	snR77	88 nt		-1.43	□□□□□ -2.64
TMA17	Q12513	YDL247W-A	YDL247W-A	75 nt		-1.48	□□□□□ -2.65
TMA17	Q12513	tP(UGG)Q	tP(UGG)Q	72 nt		-1.48	□□□□□ -2.65
TMA17	Q12513	YDL114W-A	YDL114W-A	114 nt		-1.55	□□□□□ -2.66
TMA17	Q12513	YGR122C-A	YGR122C-A	129 nt		-1.59	□□□□□ -2.66
TMA17	Q12513	YMR315W-A	YMR315W-A	108 nt		-1.63	□□□□□ -2.67
TMA17	Q12513	YDL159W-A	YDL159W-A	132 nt		-1.64	□□□□□ -2.67
TMA17	Q12513	tV(UAC)Q	tV(UAC)Q	76 nt		-1.65	□□□□□ -2.67
TMA17	Q12513	snR53	snR53	91 nt		-1.72	□□□□□ -2.68
TMA17	Q12513	tY(GUA)Q	tY(GUA)Q	84 nt		-1.96	□□□□□ -2.72
TMA17	Q12513	RPL41B	YDL133C-A	78 nt		-1.98	□□□□□ -2.73
TMA17	Q12513	snR6	snR6	112 nt		-2.01	□□□□□ -2.73
TMA17	Q12513	YOR335W-A	YOR335W-A	81 nt		-2.11	□□□□□ -2.75
TMA17	Q12513	YLR149C-A	YLR149C-A	87 nt		-2.13	□□□□□ -2.75
TMA17	Q12513	YOR309C	YOR309C	381 nt		-2.16	□□□□□ -2.76
TMA17	Q12513	snR73	snR73	106 nt		-2.26	□□□□□ -2.77
TMA17	Q12513	YBR126W-B	YBR126W-B	144 nt		-2.37	□□□□□ -2.79
TMA17	Q12513	YKL096C-B	YKL096C-B	150 nt		-2.5	□□□□□ -2.81
TMA17	Q12513	snR40	snR40	97 nt		-2.8	□□□□□ -2.86
TMA17	Q12513	YDR543C	YDR543C	300 nt		-2.81	□□□□□ -2.86
TMA17	Q12513	snR58	snR58	96 nt		-2.89	□□□□□ -2.87
TMA17	Q12513	YOL166W-A	YOL166W-A	156 nt		-3.09	□□□□□ -2.9
TMA17	Q12513	tC(GCA)Q	tC(GCA)Q	76 nt		-3.22	□□□□□ -2.92
TMA17	Q12513	snR87	snR87	109 nt		-3.28	□□□□□ -2.93
TMA17	Q12513	snR75	snR75	89 nt		-3.29	□□□□□ -2.94
TMA17	Q12513	YJR162C	YJR162C	351 nt		-4.02	□□□□□ -3.05
TMA17	Q12513	YJL136W-A	YJL136W-A	84 nt		-5.32	□□□□□ -3.26

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