Protein–RNA interactions for Protein: Q12457

NSI1, RNA polymerase I termination factor, yeastyeast

Predictions only

Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSI1Q12457 PAU9YBL108C-A 129 nt0.27□□□□□ -2.37
NSI1Q12457 YJL113WYJL113W 4647 nt0.25□□□□□ -2.37
NSI1Q12457 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.24□□□□□ -2.37
NSI1Q12457 snR161snR161 161 nt0.07□□□□□ -2.4
NSI1Q12457 snR6snR6 112 nt0.05□□□□□ -2.4
NSI1Q12457 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt0□□□□□ -2.41
NSI1Q12457 snR73snR73 106 nt-0.18□□□□□ -2.44
NSI1Q12457 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.19□□□□□ -2.44
NSI1Q12457 URB1YKL014C 5295 nt-0.24□□□□□ -2.45
NSI1Q12457 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.24□□□□□ -2.45
NSI1Q12457 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.25□□□□□ -2.45
NSI1Q12457 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.36□□□□□ -2.47
NSI1Q12457 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-0.4□□□□□ -2.47
NSI1Q12457 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.49□□□□□ -2.49
NSI1Q12457 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.49□□□□□ -2.49
NSI1Q12457 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.49□□□□□ -2.49
NSI1Q12457 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.52□□□□□ -2.49
NSI1Q12457 snR58snR58 96 nt-0.53□□□□□ -2.49
NSI1Q12457 YOR309CYOR309C 381 nt-0.55□□□□□ -2.5
NSI1Q12457 snR33snR33 183 nt-0.56□□□□□ -2.5
NSI1Q12457 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.78□□□□□ -2.53
NSI1Q12457 snR87snR87 109 nt-0.81□□□□□ -2.54
NSI1Q12457 YNR077CYNR077C 255 nt-0.86□□□□□ -2.55
NSI1Q12457 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.05□□□□□ -2.58
NSI1Q12457 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.47□□□□□ -2.64
NSI1Q12457 YDR543CYDR543C 300 nt-1.73□□□□□ -2.69
NSI1Q12457 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.96□□□□□ -2.72
NSI1Q12457 YJR162CYJR162C 351 nt-2.48□□□□□ -2.81
NSI1Q12457 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.61□□□□□ -2.83
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 2.8 ms