Protein–RNA interactions for Protein: Q12270

RBD2, Rhomboid protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RBD2Q12270 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-0.6□□□□□ -2.51
RBD2Q12270 URB1YKL014C 5295 nt-0.63□□□□□ -2.51
RBD2Q12270 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
RBD2Q12270 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
RBD2Q12270 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
RBD2Q12270 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-0.68□□□□□ -2.52
RBD2Q12270 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.68□□□□□ -2.52
RBD2Q12270 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.7□□□□□ -2.52
RBD2Q12270 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.72□□□□□ -2.52
RBD2Q12270 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.77□□□□□ -2.53
RBD2Q12270 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.88□□□□□ -2.55
RBD2Q12270 YNR077CYNR077C 255 nt-0.89□□□□□ -2.55
RBD2Q12270 snR6snR6 112 nt-0.91□□□□□ -2.56
RBD2Q12270 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.91□□□□□ -2.56
RBD2Q12270 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-0.92□□□□□ -2.56
RBD2Q12270 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.94□□□□□ -2.56
RBD2Q12270 snR73snR73 106 nt-1.06□□□□□ -2.58
RBD2Q12270 YOR309CYOR309C 381 nt-1.06□□□□□ -2.58
RBD2Q12270 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.11□□□□□ -2.59
RBD2Q12270 snR40snR40 97 nt-1.13□□□□□ -2.59
RBD2Q12270 snR75snR75 89 nt-1.24□□□□□ -2.61
RBD2Q12270 snR58snR58 96 nt-1.44□□□□□ -2.64
RBD2Q12270 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.57□□□□□ -2.66
RBD2Q12270 snR87snR87 109 nt-1.63□□□□□ -2.67
RBD2Q12270 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.81□□□□□ -2.7
RBD2Q12270 YDR543CYDR543C 300 nt-2□□□□□ -2.73
RBD2Q12270 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.08□□□□□ -2.74
RBD2Q12270 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.85□□□□□ -2.87
RBD2Q12270 YJR162CYJR162C 351 nt-2.97□□□□□ -2.88
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.8 ms