Protein–RNA interactions for Protein: Q12255

NYV1, Vacuolar v-SNARE NYV1, yeastyeast

Predictions only

Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NYV1Q12255 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.17□□□□□ -2.6
NYV1Q12255 YBL109WYBL109W 336 nt-1.19□□□□□ -2.6
NYV1Q12255 snR64snR64 101 nt-1.22□□□□□ -2.6
NYV1Q12255 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.26□□□□□ -2.61
NYV1Q12255 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-1.26□□□□□ -2.61
NYV1Q12255 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.27□□□□□ -2.61
NYV1Q12255 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-1.28□□□□□ -2.61
NYV1Q12255 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.37□□□□□ -2.63
NYV1Q12255 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-1.38□□□□□ -2.63
NYV1Q12255 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.44□□□□□ -2.64
NYV1Q12255 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-1.47□□□□□ -2.64
NYV1Q12255 snR6snR6 112 nt-1.54□□□□□ -2.66
NYV1Q12255 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.54□□□□□ -2.66
NYV1Q12255 YOR309CYOR309C 381 nt-1.54□□□□□ -2.66
NYV1Q12255 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.54□□□□□ -2.66
NYV1Q12255 snR53snR53 91 nt-1.56□□□□□ -2.66
NYV1Q12255 snR73snR73 106 nt-1.67□□□□□ -2.68
NYV1Q12255 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-1.78□□□□□ -2.69
NYV1Q12255 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.93□□□□□ -2.72
NYV1Q12255 snR40snR40 97 nt-2.16□□□□□ -2.76
NYV1Q12255 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.17□□□□□ -2.76
NYV1Q12255 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.28□□□□□ -2.77
NYV1Q12255 snR58snR58 96 nt-2.31□□□□□ -2.78
NYV1Q12255 snR87snR87 109 nt-2.41□□□□□ -2.8
NYV1Q12255 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.53□□□□□ -2.81
NYV1Q12255 YDR543CYDR543C 300 nt-2.58□□□□□ -2.82
NYV1Q12255 snR75snR75 89 nt-2.66□□□□□ -2.84
NYV1Q12255 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.84□□□□□ -3.02
NYV1Q12255 YJR162CYJR162C 351 nt-4.2□□□□□ -3.08
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 55 ms