Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.58□□□□□ -2.5
LCB4Q12246 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.58□□□□□ -2.5
LCB4Q12246 snR33snR33 183 nt-0.58□□□□□ -2.5
LCB4Q12246 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-0.59□□□□□ -2.5
LCB4Q12246 snR77snR77 88 nt-0.63□□□□□ -2.51
LCB4Q12246 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.67□□□□□ -2.52
LCB4Q12246 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-0.69□□□□□ -2.52
LCB4Q12246 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-0.75□□□□□ -2.53
LCB4Q12246 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.81□□□□□ -2.54
LCB4Q12246 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.83□□□□□ -2.54
LCB4Q12246 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.9□□□□□ -2.55
LCB4Q12246 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.95□□□□□ -2.56
LCB4Q12246 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.01□□□□□ -2.57
LCB4Q12246 snR6snR6 112 nt-1.08□□□□□ -2.58
LCB4Q12246 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.1□□□□□ -2.59
LCB4Q12246 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.12□□□□□ -2.59
LCB4Q12246 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.12□□□□□ -2.59
LCB4Q12246 snR73snR73 106 nt-1.27□□□□□ -2.61
LCB4Q12246 YOR309CYOR309C 381 nt-1.27□□□□□ -2.61
LCB4Q12246 snR40snR40 97 nt-1.35□□□□□ -2.63
LCB4Q12246 snR75snR75 89 nt-1.42□□□□□ -2.64
LCB4Q12246 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.54□□□□□ -2.66
LCB4Q12246 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.75□□□□□ -2.69
LCB4Q12246 snR58snR58 96 nt-1.76□□□□□ -2.69
LCB4Q12246 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.9□□□□□ -2.71
LCB4Q12246 snR87snR87 109 nt-1.98□□□□□ -2.73
LCB4Q12246 YDR543CYDR543C 300 nt-2.02□□□□□ -2.73
LCB4Q12246 YJR162CYJR162C 351 nt-2.74□□□□□ -2.85
LCB4Q12246 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.09□□□□□ -2.9
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.6 ms