Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.26□□□□□ -2.45
UBX3Q12229 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-0.31□□□□□ -2.46
UBX3Q12229 URB1YKL014C 5295 nt-0.5□□□□□ -2.49
UBX3Q12229 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.54□□□□□ -2.5
UBX3Q12229 snR75snR75 89 nt-0.59□□□□□ -2.5
UBX3Q12229 snR33snR33 183 nt-0.59□□□□□ -2.5
UBX3Q12229 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.63□□□□□ -2.51
UBX3Q12229 snR6snR6 112 nt-0.64□□□□□ -2.51
UBX3Q12229 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
UBX3Q12229 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.64□□□□□ -2.51
UBX3Q12229 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.65□□□□□ -2.51
UBX3Q12229 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.67□□□□□ -2.52
UBX3Q12229 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.67□□□□□ -2.52
UBX3Q12229 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.67□□□□□ -2.52
UBX3Q12229 snR40snR40 97 nt-0.7□□□□□ -2.52
UBX3Q12229 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.75□□□□□ -2.53
UBX3Q12229 snR73snR73 106 nt-0.79□□□□□ -2.54
UBX3Q12229 YNR077CYNR077C 255 nt-0.79□□□□□ -2.54
UBX3Q12229 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.85□□□□□ -2.55
UBX3Q12229 YOR309CYOR309C 381 nt-0.9□□□□□ -2.55
UBX3Q12229 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.11□□□□□ -2.59
UBX3Q12229 snR58snR58 96 nt-1.24□□□□□ -2.61
UBX3Q12229 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.26□□□□□ -2.61
UBX3Q12229 snR87snR87 109 nt-1.39□□□□□ -2.63
UBX3Q12229 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.86□□□□□ -2.71
UBX3Q12229 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.89□□□□□ -2.71
UBX3Q12229 YDR543CYDR543C 300 nt-1.97□□□□□ -2.72
UBX3Q12229 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.85□□□□□ -2.87
UBX3Q12229 YJR162CYJR162C 351 nt-2.97□□□□□ -2.88
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.8 ms