Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.92□□□□□ -2.72
USB1Q12208 snR62snR62 100 nt-1.95□□□□□ -2.72
USB1Q12208 YOR225WYOR225W 330 nt-1.95□□□□□ -2.72
USB1Q12208 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.96□□□□□ -2.72
USB1Q12208 snR85snR85 171 nt-2.02□□□□□ -2.73
USB1Q12208 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-2.02□□□□□ -2.73
USB1Q12208 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.02□□□□□ -2.73
USB1Q12208 snR64snR64 101 nt-2.09□□□□□ -2.74
USB1Q12208 ATP8Q0080 147 nt-2.19□□□□□ -2.76
USB1Q12208 Q0143Q0143 153 nt-2.36□□□□□ -2.79
USB1Q12208 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-2.4□□□□□ -2.79
USB1Q12208 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-2.41□□□□□ -2.8
USB1Q12208 YMR326CYMR326C 309 nt-2.42□□□□□ -2.8
USB1Q12208 YHR217CYHR217C 462 nt-2.44□□□□□ -2.8
USB1Q12208 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-2.49□□□□□ -2.81
USB1Q12208 Q0092Q0092 141 nt-2.55□□□□□ -2.82
USB1Q12208 snR53snR53 91 nt-2.55□□□□□ -2.82
USB1Q12208 snR87snR87 109 nt-2.6□□□□□ -2.83
USB1Q12208 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-2.61□□□□□ -2.83
USB1Q12208 YBL109WYBL109W 336 nt-2.63□□□□□ -2.83
USB1Q12208 snR58snR58 96 nt-2.74□□□□□ -2.85
USB1Q12208 YDR543CYDR543C 300 nt-2.79□□□□□ -2.86
USB1Q12208 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.81□□□□□ -2.86
USB1Q12208 snR40snR40 97 nt-2.82□□□□□ -2.86
USB1Q12208 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-2.99□□□□□ -2.89
USB1Q12208 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-3.06□□□□□ -2.9
USB1Q12208 YJR162CYJR162C 351 nt-3.7□□□□□ -3
USB1Q12208 snR75snR75 89 nt-3.74□□□□□ -3.01
USB1Q12208 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.82□□□□□ -3.02
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