Protein–RNA interactions for Protein: Q12172

YRR1, Zinc finger transcription factor YRR1, yeastyeast

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Length 810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRR1Q12172 snR128snR128 126 nt0.6□□□□□ -2.31
YRR1Q12172 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.46□□□□□ -2.34
YRR1Q12172 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.44□□□□□ -2.34
YRR1Q12172 snR161snR161 161 nt0.38□□□□□ -2.35
YRR1Q12172 RPL41BYDL133C-A 78 nt0.35□□□□□ -2.35
YRR1Q12172 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt0.29□□□□□ -2.36
YRR1Q12172 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt0.29□□□□□ -2.36
YRR1Q12172 snR6snR6 112 nt0.27□□□□□ -2.37
YRR1Q12172 snR58snR58 96 nt0.08□□□□□ -2.4
YRR1Q12172 snR73snR73 106 nt0.05□□□□□ -2.4
YRR1Q12172 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.06□□□□□ -2.42
YRR1Q12172 URB1YKL014C 5295 nt-0.09□□□□□ -2.42
YRR1Q12172 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.1□□□□□ -2.42
YRR1Q12172 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.18□□□□□ -2.44
YRR1Q12172 YNR077CYNR077C 255 nt-0.37□□□□□ -2.47
YRR1Q12172 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.48□□□□□ -2.49
YRR1Q12172 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.48□□□□□ -2.49
YRR1Q12172 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.48□□□□□ -2.49
YRR1Q12172 snR33snR33 183 nt-0.51□□□□□ -2.49
YRR1Q12172 YOR309CYOR309C 381 nt-0.54□□□□□ -2.5
YRR1Q12172 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.59□□□□□ -2.5
YRR1Q12172 snR87snR87 109 nt-0.67□□□□□ -2.52
YRR1Q12172 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.7□□□□□ -2.52
YRR1Q12172 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.97□□□□□ -2.56
YRR1Q12172 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.25□□□□□ -2.61
YRR1Q12172 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.28□□□□□ -2.61
YRR1Q12172 YDR543CYDR543C 300 nt-1.58□□□□□ -2.66
YRR1Q12172 YJR162CYJR162C 351 nt-2.18□□□□□ -2.76
YRR1Q12172 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.72□□□□□ -2.84
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 5.4 ms