Protein–RNA interactions for Protein: Q12151

UPC2, Sterol uptake control protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPC2Q12151 snR75snR75 89 nt-0.09□□□□□ -2.42
UPC2Q12151 snR161snR161 161 nt-0.13□□□□□ -2.43
UPC2Q12151 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.2□□□□□ -2.44
UPC2Q12151 URB1YKL014C 5295 nt-0.41□□□□□ -2.47
UPC2Q12151 snR40snR40 97 nt-0.46□□□□□ -2.48
UPC2Q12151 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.55□□□□□ -2.5
UPC2Q12151 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.55□□□□□ -2.5
UPC2Q12151 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.55□□□□□ -2.5
UPC2Q12151 YNR077CYNR077C 255 nt-0.56□□□□□ -2.5
UPC2Q12151 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.57□□□□□ -2.5
UPC2Q12151 snR33snR33 183 nt-0.57□□□□□ -2.5
UPC2Q12151 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.6□□□□□ -2.51
UPC2Q12151 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.61□□□□□ -2.51
UPC2Q12151 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.62□□□□□ -2.51
UPC2Q12151 snR6snR6 112 nt-0.65□□□□□ -2.51
UPC2Q12151 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.66□□□□□ -2.52
UPC2Q12151 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.66□□□□□ -2.52
UPC2Q12151 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.8□□□□□ -2.54
UPC2Q12151 snR73snR73 106 nt-0.82□□□□□ -2.54
UPC2Q12151 YOR309CYOR309C 381 nt-0.99□□□□□ -2.57
UPC2Q12151 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.09□□□□□ -2.58
UPC2Q12151 snR58snR58 96 nt-1.12□□□□□ -2.59
UPC2Q12151 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.13□□□□□ -2.59
UPC2Q12151 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.42□□□□□ -2.64
UPC2Q12151 snR87snR87 109 nt-1.51□□□□□ -2.65
UPC2Q12151 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.66□□□□□ -2.68
UPC2Q12151 YDR543CYDR543C 300 nt-1.82□□□□□ -2.7
UPC2Q12151 YJR162CYJR162C 351 nt-2.5□□□□□ -2.81
UPC2Q12151 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.8□□□□□ -2.86
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 4 ms