Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 snR85snR85 171 nt-1.65□□□□□ -2.67
NMD4Q12129 snR64snR64 101 nt-1.7□□□□□ -2.68
NMD4Q12129 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.72□□□□□ -2.68
NMD4Q12129 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-1.78□□□□□ -2.69
NMD4Q12129 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.79□□□□□ -2.7
NMD4Q12129 YBL109WYBL109W 336 nt-1.8□□□□□ -2.7
NMD4Q12129 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.81□□□□□ -2.7
NMD4Q12129 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-1.83□□□□□ -2.7
NMD4Q12129 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.84□□□□□ -2.7
NMD4Q12129 snR6snR6 112 nt-2□□□□□ -2.73
NMD4Q12129 YOR309CYOR309C 381 nt-2□□□□□ -2.73
NMD4Q12129 RPL41BYDL133C-A 78 nt-2.03□□□□□ -2.73
NMD4Q12129 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-2.04□□□□□ -2.74
NMD4Q12129 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.05□□□□□ -2.74
NMD4Q12129 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-2.11□□□□□ -2.75
NMD4Q12129 snR53snR53 91 nt-2.12□□□□□ -2.75
NMD4Q12129 snR73snR73 106 nt-2.2□□□□□ -2.76
NMD4Q12129 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.33□□□□□ -2.78
NMD4Q12129 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-2.42□□□□□ -2.8
NMD4Q12129 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-2.55□□□□□ -2.82
NMD4Q12129 YDR543CYDR543C 300 nt-2.78□□□□□ -2.85
NMD4Q12129 snR40snR40 97 nt-2.89□□□□□ -2.87
NMD4Q12129 snR58snR58 96 nt-2.97□□□□□ -2.88
NMD4Q12129 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-3□□□□□ -2.89
NMD4Q12129 snR87snR87 109 nt-3.12□□□□□ -2.91
NMD4Q12129 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-3.28□□□□□ -2.93
NMD4Q12129 snR75snR75 89 nt-3.58□□□□□ -2.98
NMD4Q12129 YJR162CYJR162C 351 nt-4.06□□□□□ -3.06
NMD4Q12129 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-4.93□□□□□ -3.2
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 3.8 ms