Protein–RNA interactions for Protein: Q12116

TMS1, Membrane protein TMS1, yeastyeast

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMS1Q12116 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-0.58□□□□□ -2.5
TMS1Q12116 snR77snR77 88 nt-0.59□□□□□ -2.5
TMS1Q12116 snR33snR33 183 nt-0.6□□□□□ -2.51
TMS1Q12116 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.66□□□□□ -2.52
TMS1Q12116 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.66□□□□□ -2.52
TMS1Q12116 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.66□□□□□ -2.52
TMS1Q12116 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-0.68□□□□□ -2.52
TMS1Q12116 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.75□□□□□ -2.53
TMS1Q12116 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.77□□□□□ -2.53
TMS1Q12116 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-0.78□□□□□ -2.53
TMS1Q12116 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.8□□□□□ -2.54
TMS1Q12116 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.81□□□□□ -2.54
TMS1Q12116 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.95□□□□□ -2.56
TMS1Q12116 snR6snR6 112 nt-1□□□□□ -2.57
TMS1Q12116 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1□□□□□ -2.57
TMS1Q12116 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1□□□□□ -2.57
TMS1Q12116 YOR309CYOR309C 381 nt-1.12□□□□□ -2.59
TMS1Q12116 snR73snR73 106 nt-1.13□□□□□ -2.59
TMS1Q12116 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.16□□□□□ -2.6
TMS1Q12116 snR40snR40 97 nt-1.22□□□□□ -2.6
TMS1Q12116 snR75snR75 89 nt-1.33□□□□□ -2.62
TMS1Q12116 snR58snR58 96 nt-1.52□□□□□ -2.65
TMS1Q12116 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.64□□□□□ -2.67
TMS1Q12116 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.69□□□□□ -2.68
TMS1Q12116 snR87snR87 109 nt-1.73□□□□□ -2.69
TMS1Q12116 YDR543CYDR543C 300 nt-1.84□□□□□ -2.7
TMS1Q12116 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.88□□□□□ -2.71
TMS1Q12116 YJR162CYJR162C 351 nt-2.94□□□□□ -2.88
TMS1Q12116 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.99□□□□□ -2.89
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.6 ms