Protein–RNA interactions for Protein: Q12098

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, yeastyeast

Predictions only

Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX4Q12098 snR77snR77 88 nt-0.95□□□□□ -2.56
SLX4Q12098 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.96□□□□□ -2.56
SLX4Q12098 snR64snR64 101 nt-1.02□□□□□ -2.57
SLX4Q12098 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-1.02□□□□□ -2.57
SLX4Q12098 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.02□□□□□ -2.57
SLX4Q12098 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.09□□□□□ -2.58
SLX4Q12098 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.18□□□□□ -2.6
SLX4Q12098 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.2□□□□□ -2.6
SLX4Q12098 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-1.21□□□□□ -2.6
SLX4Q12098 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.24□□□□□ -2.61
SLX4Q12098 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.29□□□□□ -2.62
SLX4Q12098 YOR309CYOR309C 381 nt-1.34□□□□□ -2.62
SLX4Q12098 snR53snR53 91 nt-1.34□□□□□ -2.62
SLX4Q12098 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.36□□□□□ -2.63
SLX4Q12098 snR6snR6 112 nt-1.39□□□□□ -2.63
SLX4Q12098 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.39□□□□□ -2.63
SLX4Q12098 snR73snR73 106 nt-1.5□□□□□ -2.65
SLX4Q12098 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-1.69□□□□□ -2.68
SLX4Q12098 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.73□□□□□ -2.69
SLX4Q12098 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.94□□□□□ -2.72
SLX4Q12098 snR40snR40 97 nt-1.97□□□□□ -2.72
SLX4Q12098 snR58snR58 96 nt-2.04□□□□□ -2.74
SLX4Q12098 snR87snR87 109 nt-2.11□□□□□ -2.75
SLX4Q12098 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.26□□□□□ -2.77
SLX4Q12098 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.39□□□□□ -2.79
SLX4Q12098 snR75snR75 89 nt-2.46□□□□□ -2.8
SLX4Q12098 YDR543CYDR543C 300 nt-2.48□□□□□ -2.81
SLX4Q12098 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.26□□□□□ -2.93
SLX4Q12098 YJR162CYJR162C 351 nt-3.71□□□□□ -3
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.2 ms