Protein–RNA interactions for Protein: Q12085

TY1A-GR1, Transposon Ty1-GR1 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-GR1Q12085 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1A-GR1Q12085 snR161snR161 161 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY1A-GR1Q12085 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.17□□□□□ -2.44
TY1A-GR1Q12085 snR40snR40 97 nt-0.24□□□□□ -2.45
TY1A-GR1Q12085 URB1YKL014C 5295 nt-0.44□□□□□ -2.48
TY1A-GR1Q12085 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.46□□□□□ -2.48
TY1A-GR1Q12085 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.46□□□□□ -2.48
TY1A-GR1Q12085 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.5□□□□□ -2.49
TY1A-GR1Q12085 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.5□□□□□ -2.49
TY1A-GR1Q12085 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.5□□□□□ -2.49
TY1A-GR1Q12085 snR33snR33 183 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1A-GR1Q12085 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.56□□□□□ -2.5
TY1A-GR1Q12085 snR6snR6 112 nt-0.58□□□□□ -2.5
TY1A-GR1Q12085 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.6□□□□□ -2.51
TY1A-GR1Q12085 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.66□□□□□ -2.52
TY1A-GR1Q12085 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.74□□□□□ -2.53
TY1A-GR1Q12085 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.74□□□□□ -2.53
TY1A-GR1Q12085 snR73snR73 106 nt-0.79□□□□□ -2.54
TY1A-GR1Q12085 YNR077CYNR077C 255 nt-0.91□□□□□ -2.56
TY1A-GR1Q12085 snR58snR58 96 nt-0.96□□□□□ -2.56
TY1A-GR1Q12085 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-0.98□□□□□ -2.57
TY1A-GR1Q12085 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1□□□□□ -2.57
TY1A-GR1Q12085 YOR309CYOR309C 381 nt-1.06□□□□□ -2.58
TY1A-GR1Q12085 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.31□□□□□ -2.62
TY1A-GR1Q12085 snR87snR87 109 nt-1.54□□□□□ -2.66
TY1A-GR1Q12085 YDR543CYDR543C 300 nt-1.69□□□□□ -2.68
TY1A-GR1Q12085 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.99□□□□□ -2.73
TY1A-GR1Q12085 YJR162CYJR162C 351 nt-2.28□□□□□ -2.77
TY1A-GR1Q12085 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.82□□□□□ -2.86
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 109 ms