Protein–RNA interactions for Protein: Q12078

SMF3, Iron transporter SMF3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMF3Q12078 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-1.04□□□□□ -2.58
SMF3Q12078 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.08□□□□□ -2.58
SMF3Q12078 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-1.08□□□□□ -2.58
SMF3Q12078 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.11□□□□□ -2.59
SMF3Q12078 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.12□□□□□ -2.59
SMF3Q12078 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.12□□□□□ -2.59
SMF3Q12078 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-1.13□□□□□ -2.59
SMF3Q12078 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.15□□□□□ -2.59
SMF3Q12078 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-1.2□□□□□ -2.6
SMF3Q12078 YNR077CYNR077C 255 nt-1.22□□□□□ -2.6
SMF3Q12078 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.27□□□□□ -2.61
SMF3Q12078 snR53snR53 91 nt-1.29□□□□□ -2.62
SMF3Q12078 snR6snR6 112 nt-1.35□□□□□ -2.63
SMF3Q12078 YOR309CYOR309C 381 nt-1.43□□□□□ -2.64
SMF3Q12078 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.43□□□□□ -2.64
SMF3Q12078 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.45□□□□□ -2.64
SMF3Q12078 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-1.51□□□□□ -2.65
SMF3Q12078 snR73snR73 106 nt-1.54□□□□□ -2.66
SMF3Q12078 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.75□□□□□ -2.69
SMF3Q12078 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.81□□□□□ -2.7
SMF3Q12078 snR40snR40 97 nt-1.95□□□□□ -2.72
SMF3Q12078 snR58snR58 96 nt-2.09□□□□□ -2.74
SMF3Q12078 snR87snR87 109 nt-2.23□□□□□ -2.77
SMF3Q12078 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.32□□□□□ -2.78
SMF3Q12078 snR75snR75 89 nt-2.38□□□□□ -2.79
SMF3Q12078 YDR543CYDR543C 300 nt-2.57□□□□□ -2.82
SMF3Q12078 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-3.01□□□□□ -2.89
SMF3Q12078 YJR162CYJR162C 351 nt-3.33□□□□□ -2.94
SMF3Q12078 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.49□□□□□ -2.97
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.1 ms