Protein–RNA interactions for Protein: Q12074

SPE3, Spermidine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3Q12074 snR62snR62 100 nt-2.23□□□□□ -2.77
SPE3Q12074 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.25□□□□□ -2.77
SPE3Q12074 snR73snR73 106 nt-2.27□□□□□ -2.77
SPE3Q12074 RPL41BYDL133C-A 78 nt-2.28□□□□□ -2.77
SPE3Q12074 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-2.35□□□□□ -2.79
SPE3Q12074 snR85snR85 171 nt-2.36□□□□□ -2.79
SPE3Q12074 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-2.38□□□□□ -2.79
SPE3Q12074 snR64snR64 101 nt-2.44□□□□□ -2.8
SPE3Q12074 ATP8Q0080 147 nt-2.44□□□□□ -2.8
SPE3Q12074 YDR543CYDR543C 300 nt-2.49□□□□□ -2.81
SPE3Q12074 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.5□□□□□ -2.81
SPE3Q12074 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-2.66□□□□□ -2.84
SPE3Q12074 Q0143Q0143 153 nt-2.69□□□□□ -2.84
SPE3Q12074 YMR326CYMR326C 309 nt-2.7□□□□□ -2.84
SPE3Q12074 YHR217CYHR217C 462 nt-2.77□□□□□ -2.85
SPE3Q12074 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-2.82□□□□□ -2.86
SPE3Q12074 Q0092Q0092 141 nt-2.86□□□□□ -2.87
SPE3Q12074 snR87snR87 109 nt-2.87□□□□□ -2.87
SPE3Q12074 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-2.87□□□□□ -2.87
SPE3Q12074 snR53snR53 91 nt-2.95□□□□□ -2.88
SPE3Q12074 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-3.09□□□□□ -2.9
SPE3Q12074 YBL109WYBL109W 336 nt-3.11□□□□□ -2.91
SPE3Q12074 snR58snR58 96 nt-3.19□□□□□ -2.92
SPE3Q12074 snR40snR40 97 nt-3.37□□□□□ -2.95
SPE3Q12074 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-3.38□□□□□ -2.95
SPE3Q12074 YJR162CYJR162C 351 nt-3.42□□□□□ -2.96
SPE3Q12074 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-3.6□□□□□ -2.99
SPE3Q12074 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.83□□□□□ -3.02
SPE3Q12074 snR75snR75 89 nt-4.39□□□□□ -3.11
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 4.9 ms