Protein–RNA interactions for Protein: Q12033

RIM20, pH-response regulator protein palA/RIM20, yeastyeast

Predictions only

Length 661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIM20Q12033 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.21□□□□□ -2.6
RIM20Q12033 YBL109WYBL109W 336 nt-1.23□□□□□ -2.61
RIM20Q12033 snR64snR64 101 nt-1.26□□□□□ -2.61
RIM20Q12033 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.26□□□□□ -2.61
RIM20Q12033 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.31□□□□□ -2.62
RIM20Q12033 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-1.31□□□□□ -2.62
RIM20Q12033 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-1.33□□□□□ -2.62
RIM20Q12033 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.34□□□□□ -2.62
RIM20Q12033 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.46□□□□□ -2.64
RIM20Q12033 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-1.47□□□□□ -2.64
RIM20Q12033 snR6snR6 112 nt-1.49□□□□□ -2.65
RIM20Q12033 YOR309CYOR309C 381 nt-1.52□□□□□ -2.65
RIM20Q12033 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.54□□□□□ -2.66
RIM20Q12033 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-1.59□□□□□ -2.66
RIM20Q12033 snR53snR53 91 nt-1.59□□□□□ -2.66
RIM20Q12033 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.64□□□□□ -2.67
RIM20Q12033 snR73snR73 106 nt-1.67□□□□□ -2.68
RIM20Q12033 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-1.79□□□□□ -2.7
RIM20Q12033 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.96□□□□□ -2.72
RIM20Q12033 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.18□□□□□ -2.76
RIM20Q12033 snR40snR40 97 nt-2.21□□□□□ -2.76
RIM20Q12033 snR58snR58 96 nt-2.38□□□□□ -2.79
RIM20Q12033 snR87snR87 109 nt-2.41□□□□□ -2.8
RIM20Q12033 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.44□□□□□ -2.8
RIM20Q12033 YDR543CYDR543C 300 nt-2.5□□□□□ -2.81
RIM20Q12033 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.6□□□□□ -2.83
RIM20Q12033 snR75snR75 89 nt-2.76□□□□□ -2.85
RIM20Q12033 YJR162CYJR162C 351 nt-3.82□□□□□ -3.02
RIM20Q12033 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.9□□□□□ -3.03
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 62.2 ms