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Protein–RNA interactions for Protein: Q08729
DSE3, Protein DSE3, yeast
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430 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
DSE3
Q08729
snR77
snR77
88 nt
-0.24
□□□□□ -2.45
DSE3
Q08729
YKL096C-B
YKL096C-B
150 nt
-0.3
□□□□□ -2.46
DSE3
Q08729
URB1
YKL014C
5295 nt
-0.49
□□□□□ -2.49
DSE3
Q08729
CDC65
tQ(CUG)M
72 nt
-0.55
□□□□□ -2.5
DSE3
Q08729
YHL009W-B
YHL009W-B
5409 nt
-0.56
□□□□□ -2.5
DSE3
Q08729
snR75
snR75
89 nt
-0.57
□□□□□ -2.5
DSE3
Q08729
snR33
snR33
183 nt
-0.57
□□□□□ -2.5
DSE3
Q08729
snR6
snR6
112 nt
-0.61
□□□□□ -2.51
DSE3
Q08729
YMR315W-A
YMR315W-A
108 nt
-0.67
□□□□□ -2.52
DSE3
Q08729
tP(UGG)Q
tP(UGG)Q
72 nt
-0.68
□□□□□ -2.52
DSE3
Q08729
YOR335W-A
YOR335W-A
81 nt
-0.68
□□□□□ -2.52
DSE3
Q08729
snR40
snR40
97 nt
-0.68
□□□□□ -2.52
DSE3
Q08729
RPL41B
YDL133C-A
78 nt
-0.74
□□□□□ -2.53
DSE3
Q08729
snR73
snR73
106 nt
-0.8
□□□□□ -2.54
DSE3
Q08729
tT(UGU)G1
tT(UGU)G1
72 nt
-0.8
□□□□□ -2.54
DSE3
Q08729
tT(UGU)G2
tT(UGU)G2
72 nt
-0.8
□□□□□ -2.54
DSE3
Q08729
tT(UGU)P
tT(UGU)P
72 nt
-0.8
□□□□□ -2.54
DSE3
Q08729
YOR309C
YOR309C
381 nt
-0.91
□□□□□ -2.56
DSE3
Q08729
YNR077C
YNR077C
255 nt
-1.03
□□□□□ -2.57
DSE3
Q08729
YBR223W-A
YBR223W-A
120 nt
-1.06
□□□□□ -2.58
DSE3
Q08729
tY(GUA)Q
tY(GUA)Q
84 nt
-1.1
□□□□□ -2.59
DSE3
Q08729
snR58
snR58
96 nt
-1.19
□□□□□ -2.6
DSE3
Q08729
tC(GCA)Q
tC(GCA)Q
76 nt
-1.25
□□□□□ -2.61
DSE3
Q08729
snR87
snR87
109 nt
-1.4
□□□□□ -2.63
DSE3
Q08729
YBR126W-B
YBR126W-B
144 nt
-1.85
□□□□□ -2.71
DSE3
Q08729
YDR543C
YDR543C
300 nt
-2.42
□□□□□ -2.8
DSE3
Q08729
YOL166W-A
YOL166W-A
156 nt
-2.45
□□□□□ -2.8
DSE3
Q08729
YJL136W-A
YJL136W-A
84 nt
-2.8
□□□□□ -2.86
DSE3
Q08729
YJR162C
YJR162C
351 nt
-3.61
□□□□□ -2.99
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