Protein–RNA interactions for Protein: Q08729

DSE3, Protein DSE3, yeastyeast

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE3Q08729 snR77snR77 88 nt-0.24□□□□□ -2.45
DSE3Q08729 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-0.3□□□□□ -2.46
DSE3Q08729 URB1YKL014C 5295 nt-0.49□□□□□ -2.49
DSE3Q08729 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.55□□□□□ -2.5
DSE3Q08729 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.56□□□□□ -2.5
DSE3Q08729 snR75snR75 89 nt-0.57□□□□□ -2.5
DSE3Q08729 snR33snR33 183 nt-0.57□□□□□ -2.5
DSE3Q08729 snR6snR6 112 nt-0.61□□□□□ -2.51
DSE3Q08729 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.67□□□□□ -2.52
DSE3Q08729 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.68□□□□□ -2.52
DSE3Q08729 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.68□□□□□ -2.52
DSE3Q08729 snR40snR40 97 nt-0.68□□□□□ -2.52
DSE3Q08729 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.74□□□□□ -2.53
DSE3Q08729 snR73snR73 106 nt-0.8□□□□□ -2.54
DSE3Q08729 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.8□□□□□ -2.54
DSE3Q08729 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.8□□□□□ -2.54
DSE3Q08729 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.8□□□□□ -2.54
DSE3Q08729 YOR309CYOR309C 381 nt-0.91□□□□□ -2.56
DSE3Q08729 YNR077CYNR077C 255 nt-1.03□□□□□ -2.57
DSE3Q08729 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.06□□□□□ -2.58
DSE3Q08729 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.1□□□□□ -2.59
DSE3Q08729 snR58snR58 96 nt-1.19□□□□□ -2.6
DSE3Q08729 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.25□□□□□ -2.61
DSE3Q08729 snR87snR87 109 nt-1.4□□□□□ -2.63
DSE3Q08729 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.85□□□□□ -2.71
DSE3Q08729 YDR543CYDR543C 300 nt-2.42□□□□□ -2.8
DSE3Q08729 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.45□□□□□ -2.8
DSE3Q08729 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.8□□□□□ -2.86
DSE3Q08729 YJR162CYJR162C 351 nt-3.61□□□□□ -2.99
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