Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 snR77snR77 88 nt-0.07□□□□□ -2.42
SGO1Q08490 snR75snR75 89 nt-0.14□□□□□ -2.43
SGO1Q08490 snR161snR161 161 nt-0.14□□□□□ -2.43
SGO1Q08490 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.29□□□□□ -2.46
SGO1Q08490 URB1YKL014C 5295 nt-0.37□□□□□ -2.47
SGO1Q08490 snR40snR40 97 nt-0.44□□□□□ -2.48
SGO1Q08490 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.46□□□□□ -2.48
SGO1Q08490 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.46□□□□□ -2.48
SGO1Q08490 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.46□□□□□ -2.48
SGO1Q08490 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.52□□□□□ -2.49
SGO1Q08490 snR6snR6 112 nt-0.55□□□□□ -2.5
SGO1Q08490 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.56□□□□□ -2.5
SGO1Q08490 YNR077CYNR077C 255 nt-0.59□□□□□ -2.5
SGO1Q08490 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.62□□□□□ -2.51
SGO1Q08490 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.62□□□□□ -2.51
SGO1Q08490 snR33snR33 183 nt-0.62□□□□□ -2.51
SGO1Q08490 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.63□□□□□ -2.51
SGO1Q08490 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.69□□□□□ -2.52
SGO1Q08490 snR73snR73 106 nt-0.73□□□□□ -2.53
SGO1Q08490 YOR309CYOR309C 381 nt-0.91□□□□□ -2.56
SGO1Q08490 snR58snR58 96 nt-1.11□□□□□ -2.59
SGO1Q08490 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.11□□□□□ -2.59
SGO1Q08490 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.18□□□□□ -2.6
SGO1Q08490 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.35□□□□□ -2.63
SGO1Q08490 snR87snR87 109 nt-1.39□□□□□ -2.63
SGO1Q08490 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.41□□□□□ -2.64
SGO1Q08490 YDR543CYDR543C 300 nt-1.45□□□□□ -2.64
SGO1Q08490 YJR162CYJR162C 351 nt-2.19□□□□□ -2.76
SGO1Q08490 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.99□□□□□ -2.89
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