Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sdr16c6Q05A13 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sdr16c6Q05A13 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms