Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.09□□□□□ -2.4
YAR028WP39548 snR161snR161 161 nt-0.09□□□□□ -2.42
YAR028WP39548 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.1□□□□□ -2.43
YAR028WP39548 snR40snR40 97 nt-0.23□□□□□ -2.45
YAR028WP39548 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.45□□□□□ -2.48
YAR028WP39548 snR6snR6 112 nt-0.49□□□□□ -2.49
YAR028WP39548 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.51□□□□□ -2.49
YAR028WP39548 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.52□□□□□ -2.49
YAR028WP39548 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.53□□□□□ -2.49
YAR028WP39548 snR33snR33 183 nt-0.6□□□□□ -2.51
YAR028WP39548 URB1YKL014C 5295 nt-0.6□□□□□ -2.51
YAR028WP39548 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.65□□□□□ -2.51
YAR028WP39548 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.65□□□□□ -2.51
YAR028WP39548 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.65□□□□□ -2.51
YAR028WP39548 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.65□□□□□ -2.51
YAR028WP39548 snR73snR73 106 nt-0.71□□□□□ -2.52
YAR028WP39548 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
YAR028WP39548 YOR309CYOR309C 381 nt-0.98□□□□□ -2.57
YAR028WP39548 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-0.99□□□□□ -2.57
YAR028WP39548 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1□□□□□ -2.57
YAR028WP39548 snR58snR58 96 nt-1.01□□□□□ -2.57
YAR028WP39548 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.14□□□□□ -2.59
YAR028WP39548 YNR077CYNR077C 255 nt-1.39□□□□□ -2.63
YAR028WP39548 snR87snR87 109 nt-1.46□□□□□ -2.64
YAR028WP39548 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.64□□□□□ -2.67
YAR028WP39548 YDR543CYDR543C 300 nt-2.29□□□□□ -2.78
YAR028WP39548 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.86□□□□□ -2.87
YAR028WP39548 YJR162CYJR162C 351 nt-3□□□□□ -2.89
YAR028WP39548 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.12□□□□□ -2.91
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 3.2 ms