Protein–RNA interactions for Protein: P38799

YHR078W, Uncharacterized protein YHR078W, yeastyeast

Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR078WP38799 snR161snR161 161 nt-0.24□□□□□ -2.45
YHR078WP38799 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.25□□□□□ -2.45
YHR078WP38799 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.48□□□□□ -2.49
YHR078WP38799 snR75snR75 89 nt-0.53□□□□□ -2.49
YHR078WP38799 URB1YKL014C 5295 nt-0.57□□□□□ -2.5
YHR078WP38799 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.66□□□□□ -2.52
YHR078WP38799 snR33snR33 183 nt-0.7□□□□□ -2.52
YHR078WP38799 snR6snR6 112 nt-0.77□□□□□ -2.53
YHR078WP38799 snR40snR40 97 nt-0.77□□□□□ -2.53
YHR078WP38799 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.8□□□□□ -2.54
YHR078WP38799 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.81□□□□□ -2.54
YHR078WP38799 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.81□□□□□ -2.54
YHR078WP38799 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.83□□□□□ -2.54
YHR078WP38799 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.83□□□□□ -2.54
YHR078WP38799 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.83□□□□□ -2.54
YHR078WP38799 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.85□□□□□ -2.55
YHR078WP38799 snR73snR73 106 nt-0.97□□□□□ -2.56
YHR078WP38799 YNR077CYNR077C 255 nt-1.04□□□□□ -2.58
YHR078WP38799 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.11□□□□□ -2.59
YHR078WP38799 YOR309CYOR309C 381 nt-1.15□□□□□ -2.59
YHR078WP38799 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.34□□□□□ -2.62
YHR078WP38799 snR58snR58 96 nt-1.36□□□□□ -2.63
YHR078WP38799 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.42□□□□□ -2.64
YHR078WP38799 snR87snR87 109 nt-1.72□□□□□ -2.68
YHR078WP38799 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.22□□□□□ -2.76
YHR078WP38799 YDR543CYDR543C 300 nt-2.55□□□□□ -2.82
YHR078WP38799 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.68□□□□□ -2.84
YHR078WP38799 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.49□□□□□ -2.97
YHR078WP38799 YJR162CYJR162C 351 nt-3.73□□□□□ -3.01
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 6.3 ms