Protein–RNA interactions for Protein: P38788

SSZ1, Ribosome-associated complex subunit SSZ1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1P38788 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.7□□□□□ -2.52
SSZ1P38788 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.72□□□□□ -2.52
SSZ1P38788 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-0.73□□□□□ -2.53
SSZ1P38788 snR33snR33 183 nt-0.8□□□□□ -2.54
SSZ1P38788 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.92□□□□□ -2.56
SSZ1P38788 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.92□□□□□ -2.56
SSZ1P38788 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.92□□□□□ -2.56
SSZ1P38788 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.92□□□□□ -2.56
SSZ1P38788 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-0.99□□□□□ -2.57
SSZ1P38788 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.04□□□□□ -2.58
SSZ1P38788 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.05□□□□□ -2.58
SSZ1P38788 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.18□□□□□ -2.6
SSZ1P38788 snR6snR6 112 nt-1.2□□□□□ -2.6
SSZ1P38788 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.22□□□□□ -2.6
SSZ1P38788 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.24□□□□□ -2.61
SSZ1P38788 snR73snR73 106 nt-1.39□□□□□ -2.63
SSZ1P38788 snR40snR40 97 nt-1.42□□□□□ -2.64
SSZ1P38788 snR75snR75 89 nt-1.44□□□□□ -2.64
SSZ1P38788 YOR309CYOR309C 381 nt-1.46□□□□□ -2.64
SSZ1P38788 YNR077CYNR077C 255 nt-1.47□□□□□ -2.64
SSZ1P38788 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.54□□□□□ -2.66
SSZ1P38788 snR58snR58 96 nt-1.88□□□□□ -2.71
SSZ1P38788 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.01□□□□□ -2.73
SSZ1P38788 snR87snR87 109 nt-2.22□□□□□ -2.76
SSZ1P38788 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.35□□□□□ -2.79
SSZ1P38788 YDR543CYDR543C 300 nt-2.85□□□□□ -2.87
SSZ1P38788 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-3.14□□□□□ -2.91
SSZ1P38788 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-4□□□□□ -3.05
SSZ1P38788 YJR162CYJR162C 351 nt-4.06□□□□□ -3.06
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 39 ms