Protein–RNA interactions for Protein: P36158

YKR078W, Uncharacterized protein YKR078W, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR078WP36158 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-0.34□□□□□ -2.46
YKR078WP36158 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.38□□□□□ -2.47
YKR078WP36158 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.59□□□□□ -2.5
YKR078WP36158 URB1YKL014C 5295 nt-0.63□□□□□ -2.51
YKR078WP36158 snR75snR75 89 nt-0.69□□□□□ -2.52
YKR078WP36158 snR33snR33 183 nt-0.7□□□□□ -2.52
YKR078WP36158 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.71□□□□□ -2.52
YKR078WP36158 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.71□□□□□ -2.52
YKR078WP36158 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.71□□□□□ -2.52
YKR078WP36158 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.73□□□□□ -2.53
YKR078WP36158 snR6snR6 112 nt-0.86□□□□□ -2.55
YKR078WP36158 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.86□□□□□ -2.55
YKR078WP36158 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.88□□□□□ -2.55
YKR078WP36158 snR40snR40 97 nt-0.88□□□□□ -2.55
YKR078WP36158 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.89□□□□□ -2.55
YKR078WP36158 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.92□□□□□ -2.56
YKR078WP36158 snR73snR73 106 nt-1.07□□□□□ -2.58
YKR078WP36158 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.07□□□□□ -2.58
YKR078WP36158 YOR309CYOR309C 381 nt-1.22□□□□□ -2.6
YKR078WP36158 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.32□□□□□ -2.62
YKR078WP36158 YNR077CYNR077C 255 nt-1.32□□□□□ -2.62
YKR078WP36158 snR58snR58 96 nt-1.55□□□□□ -2.66
YKR078WP36158 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.61□□□□□ -2.67
YKR078WP36158 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.83□□□□□ -2.7
YKR078WP36158 snR87snR87 109 nt-1.86□□□□□ -2.71
YKR078WP36158 YDR543CYDR543C 300 nt-2.46□□□□□ -2.8
YKR078WP36158 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.81□□□□□ -2.86
YKR078WP36158 YJR162CYJR162C 351 nt-3.36□□□□□ -2.95
YKR078WP36158 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.7□□□□□ -3
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 6 ms