Protein–RNA interactions for Protein: P36012

CSE4, Histone H3-like centromeric protein CSE4, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4P36012 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.14□□□□□ -2.39
CSE4P36012 snR161snR161 161 nt-0.04□□□□□ -2.42
CSE4P36012 snR40snR40 97 nt-0.13□□□□□ -2.43
CSE4P36012 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.18□□□□□ -2.44
CSE4P36012 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.52□□□□□ -2.49
CSE4P36012 snR6snR6 112 nt-0.54□□□□□ -2.5
CSE4P36012 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.56□□□□□ -2.5
CSE4P36012 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.57□□□□□ -2.5
CSE4P36012 URB1YKL014C 5295 nt-0.65□□□□□ -2.51
CSE4P36012 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.66□□□□□ -2.52
CSE4P36012 snR33snR33 183 nt-0.67□□□□□ -2.52
CSE4P36012 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.73□□□□□ -2.53
CSE4P36012 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.73□□□□□ -2.53
CSE4P36012 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.73□□□□□ -2.53
CSE4P36012 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.73□□□□□ -2.53
CSE4P36012 snR73snR73 106 nt-0.78□□□□□ -2.53
CSE4P36012 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.91□□□□□ -2.56
CSE4P36012 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.08□□□□□ -2.58
CSE4P36012 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.11□□□□□ -2.59
CSE4P36012 snR58snR58 96 nt-1.14□□□□□ -2.59
CSE4P36012 YOR309CYOR309C 381 nt-1.14□□□□□ -2.59
CSE4P36012 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.26□□□□□ -2.61
CSE4P36012 YNR077CYNR077C 255 nt-1.32□□□□□ -2.62
CSE4P36012 snR87snR87 109 nt-1.67□□□□□ -2.68
CSE4P36012 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.8□□□□□ -2.7
CSE4P36012 YDR543CYDR543C 300 nt-2.54□□□□□ -2.82
CSE4P36012 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-3.24□□□□□ -2.93
CSE4P36012 YJR162CYJR162C 351 nt-3.33□□□□□ -2.94
CSE4P36012 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.48□□□□□ -2.97
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